蛋白質體分析
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蛋白質體分析 Proteome Analysis

2018 年 Nature 期刊發表史上第一個人類血漿蛋白質圖譜,該研究累積 3,300 位正常人血液樣本,在分析各樣本中超過 3,600 種蛋白質含量與受測者基因圖譜資料,提供這份人類血漿蛋白質圖譜的技術團隊,是一間專注於適體 (Aptamer) 技術多年的公司 - SomaLogic,其開發出 SOMAscan 的平台,可一次檢測並定量超過 7000 種血漿蛋白。SomaLogic 已與許多國際頂尖藥廠如諾華或是默沙東等,都有使用其平台進行藥物靶點發現的合作案進行中,至 2023 年已經累計超過600篇文獻

威健已和 SomaLogic 合作,在台灣提供其蛋白質體分析服務。


  • SomaLogic 已發展 SOMAmer,其性質類似抗體,為小片段的單股 DNA 序列,這些不同序列的 DNA 分子,可摺疊成不同的構型,和特定的單白質有高親和性、高特異性的結合力;用以蛋白質體分析的 SOMAmer,接有 Fluorophore-Linker-Biotin 的設計 ( 圖一 ),以便後續的晶片探針可以並偵測。

    【圖一】SOMAmer 的結構


  • SOMAScan assay,目前已經發展可以偵測 7000 種人類蛋白質分析,步驟如下所示:
    SOMAmer 加入待檢檢體,SOMAmer 會與其特異偵測的蛋白質結合,並藉由 biotin 固定於載體上。

    將非特異結合的蛋白質洗去。

    將特異結合的 SOMAmer-蛋白質複合體進一步清洗後,檢體中蛋白質量正比於其對應結合的 SOMAmer 量。

    將 SOMAmer 沖出並純化,和製有 SOMAmer 互補序列的 DNA 探針晶片反應,以偵測每一種 SOMAmer 的量,並推算得對應蛋白質含量。

    SomaLogic 的蛋白質體分析技術,欲深入了解,請見原廠影片

檢體需求

檢體類型及儲放條件 注意
標準檢體類型 人類血漿、血清、尿液 其他檢體類型請洽威健
血漿、血清適用抗凝劑 EDTA, citrate, CTAD, heparin 皆可 EDTA 為佳;將血液於室溫下離心 2200 x g (not RPM) 15分鐘,取液體層
血漿、血清提供體積 55uL x 2 管,
管材須為 0.5 mL screw top, 2D-barcoded, Thermo Scientific™ Matrix™ tubes (Thermo Scientific™ Catalog number: 3744)
尿液 260uL x 2 管,
管材須為 0.5 mL screw top, 2D-barcoded, Thermo Scientific™ Matrix™ tubes (Thermo Scientific™ Catalog number: 3744)
儲存溫度 -80°C

SOMAScan assay 特點

SOMAScan Assay
再現性 Median CV =~5% (for plama)
偵測蛋白質種類 7000 種人類蛋白質
Dynamic Range 10 log from fM~uM

服務產品

SomaScan 7K ( 蛋白質一覽表 )

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