蛋白質體分析 Proteome Analysis

• SomaLogic 已發展 SOMAmer，其性質類似抗體，為小片段的單股 DNA 序列，這些不同序列的 DNA 分子，可摺疊成不同的構型，和特定的單白質有高親和性、高特異性的結合力；用以蛋白質體分析的 SOMAmer，接有 Fluorophore-Linker-Biotin 的設計 ( 圖一 )，以便後續的晶片探針可以並偵測。

  【圖一】SOMAmer 的結構



• SOMAScan assay，目前已經發展可以偵測 7000 種人類蛋白質分析，步驟如下所示：

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  SOMAmer 加入待檢檢體，SOMAmer 會與其特異偵測的蛋白質結合，並藉由 biotin 固定於載體上。

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  將非特異結合的蛋白質洗去。

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  將特異結合的 SOMAmer-蛋白質複合體進一步清洗後，檢體中蛋白質量正比於其對應結合的 SOMAmer 量。

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  將 SOMAmer 沖出並純化，和製有 SOMAmer 互補序列的 DNA 探針晶片反應，以偵測每一種 SOMAmer 的量，並推算得對應蛋白質含量。

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  SomaLogic 的蛋白質體分析技術，欲深入了解，請見原廠影片。

檢體需求

	檢體類型及儲放條件	注意
標準檢體類型	人類血漿、血清、尿液	其他檢體類型請洽威健
血漿、血清適用抗凝劑	EDTA, citrate, CTAD, heparin 皆可	EDTA 為佳；將血液於室溫下離心 2200 x g (not RPM) 15分鐘，取液體層
血漿、血清提供體積	55uL x 2 管， 管材須為 0.5 mL screw top, 2D-barcoded, Thermo Scientific™ Matrix™ tubes (Thermo Scientific™ Catalog number: 3744)
尿液	260uL x 2 管， 管材須為 0.5 mL screw top, 2D-barcoded, Thermo Scientific™ Matrix™ tubes (Thermo Scientific™ Catalog number: 3744)
儲存溫度	-80°C

SOMAScan assay 特點

	SOMAScan Assay
再現性	Median CV =~5% (for plama)
偵測蛋白質種類	7000 種人類蛋白質
Dynamic Range	10 log from fM~uM

服務產品

SomaScan 7K ( 蛋白質一覽表 )

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