SINGLE CELL NGS PROFILING

Single Cell NGS Profiling NGS Service

單細胞定序分析能在大規模細胞群中研究單個細胞的基因表現,利用 10x Genomics 平台處理細胞,即可進行定序。解析單細胞層次,可掌握以往群體平均易被隱蔽的資訊,助於全面了解細胞在不同階段的基因變化、與異質性樣品的每個重要資訊,藉此挖掘新的細胞類型,提供更全面、深入的研究資訊。


威健生技為台灣唯一雙認證 Single Cell Expression、Single Cell ATAC 服務商,包含樣本製備、實機操作到數據分析皆經過原廠認可,搭配完整事前案件評估、數據分析建議可協助使用者取得最優質的單細胞實驗成果。


實驗流程

利用 10x Genomics 的 GemCode™ 專利油滴微珠技術,將單顆細胞與帶有 10x barcode 的 bead 包覆在油滴內,即可進行後續的定序前建庫流程。

實驗策略

平均單顆細胞 50000 reads 的定序量

分析流程及內容

利用 Cell Ranger 軟體分析數據


依據服務類型獲得不同的分析成果

  1. 基因表現 – 標準型 Single cell gene expression V3
    tSNE / UMAP plot、分群heatmap、Receptor列表、基因富集分析
  2. 基因表現 – 篩選型 Single cell gene expression v3 rare
    樣品差異分析、tSNE / UMAP plot、分群heatmap
  3. 基因調控 – 凍樣型 Single cell ATAC
    tSNE plot、Enriched Motifs列表、Promoter / Peak列表

  • tSNE

  • UMAP

  • heatmap

  • Enrichment


實驗效能

以 10x 認證 PBMCs 單細胞項目為例,威健數據有效區分不同類型細胞,且由於威健嚴格遵循 10x Genomics 建議操作流程,搭配豐富的定序量,實驗結果皆優於原廠認證標準。

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